佩恩的飞行能力是一个独特的战斗机制，其设计灵感直接来源于原作中长门通过轮回眼操控外道魔像的力量。佩恩六道本身并不具备飞行能力，但天道佩恩在战斗中可以通过轮回眼的引力与斥力操控实现空中移动。这种能力在游戏中表现为神罗天征和万象天引的技能组合，前者释放斥力弹开敌人并短暂滞空，后者利用引力吸附目标并调整自身位置。长门通过透支生命力和外道魔像的查克拉支持这一能力，这与原作中佩恩入侵木叶时天道悬浮空中的场景一致。
游戏内进一步细化了飞行机制，例如枫新佩恩六道的飞行状态通过二技能鳞缠回翔触发，充能后可在空中持续移动并提升移速，但释放秘卷或通灵会强制落地。这种设计既还原了原作中佩恩依靠轮回眼力量短暂飞行的设定，又结合了游戏平衡性需求。飞行状态下普攻会变为空中专属动作，如枫的4A翅斩波攻击，而地面与空中技能形态差异也体现了轮回眼对不同战斗环境的适应性。
从技能逻辑上看，佩恩的飞行本质是查克拉形态变化的延伸。饿鬼道的封术吸印能吸收对手攻击转化为自身能量，这为飞行提供了查克拉支持；而修罗道的机械改造躯体则增强了空中战斗的稳定性。游戏通过六道切换系统将这些特性整合，例如漂泊浪客佩恩可通过切换畜生道辅助获得Y轴位移加成，间接实现战术性浮空。这种多角色协作的飞行机制，与长门通过六道共享视野控制佩恩的设定高度吻合。
开发者对飞行能力的限制也遵循原作逻辑。例如天道佩恩的奥义超·神罗天征会消耗大量查克拉导致强制落地，对应长门过度使用轮回眼后身体衰竭的剧情。游戏内飞行时间受能量条或冷却时间约束，而原作中佩恩的飞行同样无法持久，需依赖畜生道的通灵兽进行接力移动。这种设计既保持了战斗流畅性，又避免了角色强度失衡。
从轮回眼的基础引力操控，到外道魔像的能量供给，再到六道傀儡的协同作战，这些元素共同构成了飞行能力的叙事与玩法基础。玩家在操作时需要兼顾查克拉管理、技能衔接和位置判断，这种多维度的战斗体验正是佩恩角色魅力的核心所在。
